Yeni CRISPR testi balgamdaki tüberkülozu %100 doğrulukla tespit ediyor

Princeton Üniversitesi araştırmacıları, balgamda tüberkülozu %100 duyarlılık ve özgüllükle doğrudan tespit eden yeni bir tanı testi olan SHINE-TB'yi geliştirdiler. Teknoloji, CRISPR sistemini kullanıyor ve özel bir ekipmana ihtiyaç duymadan 37°C'de tek ve basit bir kapta çalışıyor. Science Advances'ta yayınlanan çalışma, testin kaynakların kısıtlı olduğu ortamlarda tüberküloz teşhisi için Dünya Sağlık Örgütü kriterlerini karşıladığını gösteriyor.

Mycobacterium tuberculosis'in neden olduğu tüberküloz, dünya çapında en ciddi bulaşıcı hastalıklardan biri olmaya devam etmektedir. Etkili tedaviler mevcut olsa da, tanı koymak hâlâ zordur. Kültür yöntemleri oldukça hassas ancak yavaştır, balgam mikroskopisi hızlı ancak kesin sonuçlar vermez ve PCR testleri pahalı ekipman ve tek kullanımlık kartuşlar gerektirir. Kaynakları sınırlı birçok ülke, enfeksiyonu tespit etmek için hâlâ etkili araçlardan yoksundur.

Yeni SHINE-TB testi, rekombinasyon polimeraz amplifikasyonunu CRISPR sistemiyle (Cas13a ve Cas12a) birleştirerek, iki korunmuş tüberküloz bakterisi dizisinin (IS6110 ve IS1081) ve iç kontrol olarak insan DNA'sının paralel olarak tespit edilmesini sağlıyor.

Klinik çalışmaya, tüberküloz semptomları gösteren 13 yetişkin hastadan alınan balgam örneği dahil edildi. Sonuçlar kesindi: Altın standart bakteri kültürüyle karşılaştırıldığında %100 duyarlılık (6/6) ve %100 özgüllük (7/7) . Buna karşılık, GeneXpert Ultra aynı örnek setinde %100 duyarlılık elde ederken, yalnızca %86 özgüllük elde etti.

Test , 37°C'de çalışır ve karmaşık laboratuvar ekipmanlarına ihtiyaç duymadan tek bir kapta sonuç verir. Okumalar basit bir kağıt şerit üzerinde yapılabilir ve dondurarak kurutma sayesinde test kitleri soğutma gerektirmeden saklanabilir ve taşınabilir.

M. tuberculosis H37Rv suşu için tespit limiti 69 CFU/ml, M. bovis BCG suşu için ise 80,5 CFU/ml olup, diğer bakteri veya mantarlarla çapraz reaksiyon gözlenmedi.

Dünya Sağlık Örgütü (WHO), hasta başı tüberküloz tanı testleri için minimum parametreleri şu şekilde belirlemiştir: duyarlılık ≥%85 ve düşük karmaşıklıktaki testler için ≥%90. SHINE-TB bu kriterleri karşılamakla kalmayıp, laboratuvar yöntemleriyle karşılaştırılabilir bir performans elde ederek bunları aşmaktadır.

Çalışma yazarlarının vurguladığı gibi, yeni teknoloji tanı sürecini önemli ölçüde hızlandırabilir: